Sí, hay diferencias importantes. El ghee es mantequilla clarificada, lo que significa que se le quitan los sólidos lácteos (lactosa y caseína).
Esto lo hace apto para intolerantes y sube su punto de humo, ideal para cocinar a altas temperaturas sin que se queme. Nutricionalmente, es grasa, pero la ausencia de esos componentes lo diferencia. No es "sacar los cuartos", es un producto diferente :).