Marta, las salchichas envasadas que llamas "cocidas" ya han pasado por un proceso térmico en fábrica. Eso significa que no están crudas.
Ahora bien, aunque se pueden consumir así, siempre existe el riesgo de contaminación posterior, como la Listeria monocytogenes, que puede crecer en refrigeración. Por eso, mi consejo es que siempre las calientes. No es tanto por la cocción inicial, sino por higiene y seguridad alimentaria. No son el alimento más sano para un deportista, pero si las comes, hazlo con garantias. Como decía mi abuela, con la comida, mucho ojo.